阿尔马格罗本人的身体太虚弱了，以致无法长时间骑在马上，只能斜倚在桥舆上，从附近一处高地观看这场战斗，全神贯注着这场战斗的胜负，他感到他的荣誉、命运和生命本身全在此一举。他以笔墨无法形容的极度痛苦看到他忠诚的追随者在经过艰苦卓绝的搏斗之后被他们的敌手击倒。直到他相信一切都完了的时候，才骑上一匹骡子，逃回库斯科的要塞里暂作躲藏。敌人迅速尾追到那里，将他俘获，得意洋洋地把他押解到这座首府。在这里，他虽然病得很厉害，仍然被戴上镣铐，关押在他曾监禁过皮萨罗兄弟的那座石头建筑物的同一个房间里。

阿尔马格罗被俘之后，被关押在原先监禁印加王曼科的监狱里。监狱设在先前关押埃尔南多和贡萨洛等人的那个太阳神庙里。为了报复这位智利帮军队的元帅，埃尔南多也让人给他戴上了手铐和脚镣。

因为知道阿尔马格罗的病情严重，埃尔南多在战斗结束的第二天早上就来到了太阳神庙，看望阿尔马格罗。他进到了太阳神庙的大门，看守的士兵又给他打开了第二道门，他才进到了关押阿尔马格罗的牢房里。

“你好，我亲爱的老朋友。”埃尔南多不无嘲讽地对阿尔马格罗说。

阿尔马格罗躺在一张小床上，一副有气无力和重病在身的模样，他冷冷地说，“我要尽快地见到皮萨罗侯爵。”

这位1475年出生的西班牙冒险家和征服者现年已65岁，因为几十年来的征战和冒险，多次受伤，一只眼睛早就瞎了，所以，埃尔南多总是叫他“独眼将军”。特别是前不久的远征智利，在经历了那种噩梦般的远征与冒险之后，他的身体就一下子垮了下来，赶路和行军再也不能像以前那样可以在马上颠簸上一整天了。年龄一大，健康状况一差，各种各样的病就找来了。近来，他反反复复地病了好几次，健康情况一天不如一天。以致吃饭和休息都受到了影响，更别说行军和作战。本来，战前他就病倒了，可是，为了观战，他还是骑着一头小毛驴，在卫兵的护卫下，站在一座山顶上。可是，这场惨败让他彻底地绝望了，感到自己在世的时间已经不多了。

埃尔南多对他说，“侯爵先生眼下正忙，我想他一有时间肯定就会过来看你。”

阿尔马格罗用哀求的口气说，“我不行了，活不了几天了。但我想见见他，有话要对他说。”

埃尔南多安慰着他说，“别那么悲观，我亲爱的朋友。我会尽其所能照顾好你。”说着，便让人叫来了军医给阿尔马格罗诊病。军医是位40来岁的西班牙人，他对阿尔马格罗问了问情况，就给他诊断了一会，然后对阿尔马格罗和埃尔南多说，“这位将军的病情很重，必须要好好地照顾，否则，病情继续加重，生命恐怕会有危险。”

埃尔南多听着，继续用安慰的口气对阿尔马格罗说，“请阿尔马格罗将军好生休养，只要侯爵先生一来库斯科，我就会把你马上放了。”然后，又对看守牢房的步兵少尉说，“你要想一些办法来保证阿尔马格罗将军的健康，出了问题，我拿你试问。”

说完，他便离开了牢房，回到了贞女宫里的一间办公室兼卧室。原先他是在那座印加人搞庆祝活动的大屋里居住，可是，那个大屋在奥尔戈涅斯带士兵围攻库斯科时给烧掉了，所以，他只能在贞女宫里找个房间先住着。他让人把负责伙食的一名少尉找来，对他说，“你想办法把一些骆马肉和土豆给太阳神庙那边送去，就说这是给阿尔马格罗增加营养，他看样子好像快不行了，无论如何要让他的病情快点有好转。”

负责伙食的少尉说，“我明白，上尉先生。”

等负责伙食的少尉离开后，埃尔南多又把斯柯达叫来，对他说，“你想些办法动员士兵们用各种方式来控告阿尔马格罗，对他的揭露越深刻越致命越好，我们要通过这次对他的控告和起诉，让他的名声彻底败坏。”

斯柯达说，“遵命，上尉先生。”